Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Республики Башкортостан Поликлиника № 48 города Уфа выделена в самостоятельное учреждение 16 октября 1978 г. из состава поликлиники №46 Кировского района г. Уфы. Размещалась поликлиника в цокольных этажах пятиэтажных жилых домов № 3 и 5 по ул. Губайдуллина, обслуживая поначалу детское и взрослое население прикрепленной территории.
В 1995 году поликлиника разместилась на двух этажах трехэтажного здания бывшей трикотажной фабрики по адресу Губайдуллина д.21/1, к этому времени маленькие пациенты уже были переданы детской поликлинике. Еще через два года открылось новое флюорорентгенологическое отделение, разместившееся на первом этаже жилого дома по улице Степана Злобина д.42. В 2004 году также на первом этаже жилого дома по улице Степана Злобина д. 38 начал работу филиал поликлиники. В том же году в поликлинике принял первых пациентов дневной стационар.
С февраля 2005 года руководителем Поликлиники №48 назначен Наиль Хашимович Насибуллин, врач высшей категории, профессионально грамотное руководство которого обеспечивает успешную реализацию поставленных коллективом задач, направленных на повышение качества и доступности медицинской помощи, уменьшение медико – социальных последствий болезней, сокращение смертности и увеличение средней продолжительности жизни.
В 2010 году открылся межмуниципальный онкологический центр, который обслуживает прикрепленное население поликлиник №1, 46, 47, 48, 49, 52.
В рамках реализации мероприятий направленных на совершенствование медицинской помощи онкологическим больным при поддержке МЗ РБ приобретено медицинское оборудование:
Аппаратно-програмный комплекс для телемедицинских консультаций
Маммограф рентгеновский и приставка для прицельной маммографии Комплекс рентгеновский диагностический в составе (на 3 места)
Анализатор автоматический фотометрический с принадлежностями
Аппарат ультразвуковой диагностический медицинский сканирующий
Колонофиброскоп
Бронхофиброскоп
Гастрофиброскоп
Микроскоп медицинский
Центрифуга
В настоящее время поликлиника оказывает квалифицированную медицинскую помощь населению численностью 28900 человек, ежедневно поликлинику и ее филиалы посещают не менее 300 человек в смену. В поликлинике ведут прием пациентов врачи терапевтического, физиотерапевтического, рентгенологического отделения, клинико-диагностической лаборатории, врачи узких специальностей, оказывается доврачебная помощь.