Валуйская центральная районная больница имеет в своем составе такие структурные подразделения: акушерское отделение, анестезиолого-реаниматологическое отделение, гинекологическое отделение, диагностическое отделение, дневной стационар, женская консультация, инфекционное отделение, кардиологическое отделение, клиническая лаборатория, наркологическое отделение, нейрососудистое отделение, оториноларингологическое отделение, терапевтическое отделение, травматологическое отделение, хирургическое отделение.