В структуре больницы функционирует 15 клинических специализированных отделений, 5 специализированных детских медицинских центров и 18 вспомогательных консультативно-диагностических и параклинических отделений и кабинетов, Амбулаторно-поликлиническая служба представлена кабинетами: врача детского онколога, врача гематолога, врача нефролога, врача детского уролога-андролога, врача невролога. Стационар с круглосуточным пребыванием пациентов на 400 коек.Служба СМП – Краевой неонатальный центр с двумя выездными бригадами реаниматологов-неонатологов.