Центр гигиены и эпидемиологии №5 Федерального медико-биологического агентства является Федеральным государственным бюджетным учреждением здравоохранения.
Предметом деятельности Учреждения является обеспечение деятельности Межрегионального управления №5 ФМБА России в сфере санитарно-эпидемиологического благополучия работников организаций с особо опасными условиями труда и населения отдельных территорий, условия работы и проживания в которых связаны с воздействием опасных для здоровья человека физических, химических и биологических факторов, в соответствии с перечнями организаций и территорий, подлежащих обслуживанию ФМБА России.