В структуру Республиканской больницы входит и поликлиническое отделение, которое обслуживает население города Горно-Алтайска. Республиканская больница оказывает специализированную консультативно-диагностическую, лечебную помощь населению районов и организационно-методическую помощь специалистам районных больниц. С этой целью ежегодно специалисты больницы выезжают в районы республики, консультируют пациентов, проводят операции, проводят отбор пациентов на лечение и обследование в условиях республиканской больницы, решают вопросы направления пациентов на высокотехнологичную медицинскую помощь.