В 2004г. поликлиника получила статус самостоятельного юридического лица – МУЗ «Ейская стоматологическая поликлиника». В апреле 2008г. в связи с объединением муниципального образования город Ейск и муниципального образования Ейский район, в состав поликлиники вошли 10 сельских стоматологических кабинетов.
В связи с этим изменено наименование учреждения на МУЗ Ейского района «Стоматологическая поликлиника».
Основная база имеет общую площадь 655 кв. м. В отдельно стоящем помещении располагается рентген-кабинет и хозяйственная служба.
В приемном покое ЦРБ оказывается стоматологическая помощь пациентам стационара. Экстренная и неотложная помощь в выходные и праздничные дни, в ночное время — врачами стоматологического кабинета и ургентными стоматологами-хирургами по графику. Пациентам, которым необходима стоматологическая помощь на дому, обеспечиваются выезды хирургов-стоматологов, терапевтов и ортопедов.
МУЗ Ейского района «Стоматологическая поликлиника» выполняет муниципальные заказы по ОМС и льготному зубопротезированию. На основной базе оказываются платные услуги. В сельских кабинетах платных лечебных услуг нет.
Детское отделение в 1979г. было переведено на ул. Гоголя, 157. Возглавляет детскую стоматологическую службу, вот уже более 30 лет — врач высшей категории Гацько Наталья Анатольевна. Силами детского отделения ведется ежегодная плановая диспансеризация детей города и района.